个人所得税生产经营申报流程如下：登录自然人电子税务局（扣缴端） ：打开电脑端的软件“自然人电子税务局（扣缴端）”，使用【申报密码登录】。选择需要申报的单位名称，输入相关信息进行登录。采集并报送投资人信息 ：在“代扣代缴”的“人员信息采集”里采集并报送投资人信息。检查并更新单位信息 ：点击自然人电子税务局扣缴端上方的【生产经营】-【单位信息】-【申报管理】-【征收方式】-【更新】，检查信息是否正确。预缴纳税申报 ：点击【预缴纳税申报】，确认“税款所属期”，填写收入总额、成本费用等“利润信息”（注意填写的是累计数据）。双击打开投资人填写报表，信息确认无误后点击“确定”，然后点击左上角“保存”按钮。网上报税 ：点击【网上报税】-【网上申报】，选中“未申报”数据，点击“发送申报”。稍后可点击“获取反馈”按钮，查看申报状态。税款缴纳 ：申报成功后，若有税款，点击“税款缴纳”进行缴款。提交申报表 （如适用）：前往税务机关办税大厅领取个税生产经营所得的申报表，按要求填写申报表，并将填写好的申报表提交至窗口进行申报。