本地申报时已抵扣的预缴税款，若更正外管证预缴记录，需同步调整本地申报，补缴相应增值税。是否产生滞纳金取决于补缴时间：若在申报期内主动更正，通常不加收滞纳金；若被税务机关检查发现后补缴，可能从申报期满次日起计算滞纳金。若不更正，本地抵扣的预缴税款无合法依据，后续税务稽查可能认定为少缴税款，要求补税并加收滞纳金，还可能影响纳税信用等级。建议主动联系两地税务机关协调处理，避免风险累积。

这种情况属于误预缴且已完成外管证反馈。建议联系项目所在地税务机关，说明该笔业务属于材料销售而非建筑服务，申请更正预缴记录并退税或抵减后续应缴税款。同时，在本地税务机关做申报调整，确保抵扣数据准确。