A公司应将B公司代发的200万工资作为工程成本入账。具体操作如下：1. **账务处理**：* 借：工程施工 - 合同成本 - 人工费 200万* 贷：应收账款 - B公司 200万* 或 贷：预收账款 - B公司 200万（根据与B公司的结算方式选择）2. **凭证依据**：* A公司需要向B公司索取**代发工资的明细清单**（包括工人姓名、身份证号、工资金额、发放时间等），并最好由双方盖章确认。* A公司需与B公司签订一份**补充协议或书面说明**，明确这200万是B公司代A公司支付的项目工人工资，属于工程款的一部分，用以冲抵应付工程款。* 这些文件将作为A公司记账的原始凭证。3. **税务处理**：* 这部分工资属于A公司的成本，A公司需按规定取得合规的**劳务发票**（如由劳务公司开具）或进行**个人所得税的申报扣缴**（如直接雇佣工人），才能在企业所得税前扣除。仅凭代发清单可能面临税务风险，需尽快完善凭证链。