不会影响。企业所得税申报时，职工薪酬支出按实际发放的工资总额计算，生育津贴属于社保补贴性质，不计入工资总额。账务处理中通过应付职工薪酬科目过渡，最终管理费冲减的是公司承担的工资部分，与个税申报的工资额保持一致。个税申报仅针对员工实际到手工资，生育津贴免征个税，两者统计口径不同，不会造成数据不一致。