个人代开房租发票税率显示免税，通常是因为月租金收入未超过10万元（2023年政策），免征增值税。公司做账时，不需要在个税APP里申报这张发票的税款。公司作为承租方，有义务代扣代缴出租方的个人所得税，税率一般为20%（财产租赁所得），但具体税额需按租金收入减除相关税费后计算。公司应在支付租金时扣缴个税，并通过自然人电子税务局（扣缴端）申报，而非个税APP。