小规模纳税人长期无业务但未做账，仅按6月报表报税，存在以下影响：1. 银行利息收入0.01元未入账，导致申报数据不准确，可能被税务机关认定为申报不实，面临罚款或滞纳金。2. 长期零申报或未如实申报，可能触发税务稽查，影响企业纳税信用等级。3. 5月31日截止的年度汇算清缴不能直接使用去年6月报表，必须根据实际经营情况（包括利息收入）调整账务后申报，否则属于虚假申报，后果包括补税、罚款及信用降级。建议立即补做账务，如实申报。