不可以。2025年实际发生的费用，即使取得的是2024年开具的专用发票，也不得抵扣增值税。因为发票开具时间早于费用实际发生期间，不符合增值税进项税额抵扣的时间性要求。

该企业在 2024 年作为小规模纳税人期间有生产经营收入，且已按照销售额和征收率简易计算应纳税额申报缴纳增值税，那么 2024 年的费用在 2025 年收到专票，是不可以在 2025 年勾选抵扣增值税的。因为小规模纳税人期间实行简易计税方法，不得抵扣进项税额。