根据《财政部 国家税务总局关于合伙企业合伙人所得税问题的通知》(财税[2008]159号)，合伙企业生产经营所得采取"先分后税"原则。在计算应纳税所得额时，未实际形成的公允价值变动收益不计入应纳税所得额，只有实际实现的收益才需要计入。因此，合伙企业未实际形成收益的公允价值变动收益应当扣减掉。